尚可喜多次招降，杜永和不从。
守城的南明军队誓死抵抗，广州城内人民不分男女老幼，全部加入守城战斗。见广州难以猝拨，尚可喜与耿继茂分为两部，分为两大进攻部分，准备持久围城，在打消耗战的同时，时刻寻找机会破城。他们四处抓掳百姓，强迫当地人民为清军挖壕修垒。
广州守城战，持续达十月之久。清军拼死冲锋，南明军奋死守卫，双方拉锯一样相互攻杀，士兵、平民死伤数万，加之溽暑疾疫，城内城外死尸成堆。
由于广州城高壁坚，清军久攻不下。
胶着期间，把守西门的明将范承恩降清，开门纳敌，终于使南明守军前功尽弃。这位奸贼，本为淮安胥吏出身，乱世抡枪，混上个将爷当，实则无文韬，缺武略，草包一个，在军中一直为人所轻。大凡没有本事的人，自尊心还特强，对别人的评价十分敏感。一日，城中诸将为永历帝祝寿，广州主将杜永和酒喝多了些，笑骂范承恩是“草包”。就为这两个字，范承恩报复，暗中向清朝投降，广州城最终为清军所克。
范承恩不仅与清军约降开城门，他还率自己人掘开炮台之外用以作掩护的水堰，使得清军能迅速攻入战略制高点。
尚可喜很有演戏天才，他在命令士兵抱草填水洼涉进后，亲自指挥亲兵用长斧砍开外栅。临进攻的时候，他脱去甲胄，摆出要身先士卒率先登城的样子。
其手下亲兵泣谏，几个人死死抱住这位“王爷”，不要他先上。
尚可喜忽地一声抽出腰刀，做自刎状，大喝：“士兵攻城不上，你们又不让我上，让我如何对得起大清皇上，我今天就死在这里吧！”
众亲将听话听声，皆嗷然奋起，掉头往城疾奔当肉盾，率清兵冒死登城。
南明军勇武非常，拼死捍卫城池。由于叛徒范承恩开西门，又有清军新调来的红夷大炮轰崩数十丈城墙，守军终于不支。
经过半天肉搏之后，近万明军被杀，堕入海中淹死的明军几近两、三万人。
木棉花开血样红（2）
见城已破，杜永和只得登船逃走（此人最后在琼州降清，没能善始善终）。
广州城陷，准确日期为1650年十一月三日。
攻入广州后，大汉奸尚可喜怒极，下令屠城。根据各种史料和笔记，可推算出清军在广州城内杀二十多万（不是笔记《橡坪诗话》说的六十多万），血流成渠，积尸成山。广州方园四十里，最终被杀得仅剩七人（《广州城坊志》，黄佛颐）。
当时在中国的意大利传教士卫匡国（Martin Martini）著有《鞑靼战纪》，他这样记载广州大屠杀：“他们（清军）不论男女老幼，一律残酷杀死，士兵们挥刀高喊：‘杀！杀！杀死这些反叛的蛮子’……最后，他们在12月6日发出布告，宣布封刀。除去攻城期间死掉的人以外，他们已经屠杀了十万人。”
卫匡国所估之数，只是他眼见耳闻的一个数字。广州周围地区被杀的居民，数目远远不止这些。
值得一提的是，浴血奋战的南明将士中，还有不少信仰###教的“达官兵”。“达官兵”最早是明初归附明朝的元朝残军，其中包括蒙古人、色目人等少数民族。由于其间回回人众多，明朝官方文件就以“达”或“鞑”，称之为“达人”、“达官兵”、“土达”等。死于广州城守最有名的三位回族将领，是羽凤麒、马承祖和之浮这三个人，他们被称为“教门三忠”。为此，明朝遣民诗人陈恭尹曾写诗，专门颂赞为大明死难的羽凤麟：
天方为教本坚刚，受命先朝卫五羊。生死只殉城下土，姓名不愧羽林郎。血流大地终成碧，骨化飞尘久亦香。世禄几家能矢报，为君歌此问苍茫。
大汉奸尚可喜攻占广州后，坐镇指挥。喘定后，他在广州旧城为自己和耿继茂大修藩王府。饱经战乱的广东人民，膏血横流，成为奢豪华丽王府的点缀。后来，有人上书清廷，指出广东之地不能忍受“二王”坐镇的盘剥，耿继茂才被调镇四川（后改广西、福建）。于是，广东就成为尚可喜一家的地盘。
珠江流域本来就是富庶之地，兼有市舶之利，尚可喜富甲一方，连王府门前的一对大石狮皆用上好良玉雕成，可谓穷奢极欲。
还没放下屠刀，尚可喜就想立地成佛。在广州期间，这个汉奸王爷崇佛多多，广铸佛像，大盖庙宇，现在广州的华林寺、海幢寺、光孝寺等处庙宇，皆是当时他督民所建。民脂民膏，又因他为自己一家的“修行”而流入恶僧之手。
《鼎湖山志》中载有尚可喜致庆云寺主持的一封信，上面写道：“……（我）向年提师入粤，屠戮稍多。虽云火焰昆岗，难分玉石，然而血流飘杵，恐干天和。内返诸心，夙夜自愧……”
老汉奸不打自招，道出他攻占广东时犯下的杀人罪行。所以，供佛养僧，无非是想为他自己和全家祈福消灾罢了。
康熙十二年，吴三桂反清。转年，人在这福建的耿精忠响应。康熙十五年，尚可喜儿子尚之信劫持其父，也和吴三桂一起树起反旗。三王联动反清，即清史上的“三藩之乱”。
知道自己儿子参与对清朝的叛乱，七十多岁的老汉奸又气又恼，上吊后被人救治，但不久即惶急而死。
见吴三桂势蹙，尚可喜的儿子尚之信反反复复，不久即向清军“投降”。
天下大定后，清廷寻衅，杀掉尚之信及其兄弟数人，充公尚家王府的全部财产。但是，老贼尚可喜繁殖力强，有子女一百多人，并未被清廷全部杀掉。主要原因是，清廷派人剖棺验尸时，发现这个老贼一身满清装束，深博康熙欢心，觉得他一心忠于大清，就免杀他其余的亲属。
死罪饶过，活罪不免，尚可喜家族余人全被遣返回尚可喜的辽东老家。
有时候，读者们可能觉得苍天无眼。袁崇焕耿耿忠心，被明朝冤杀后，竟无一点血脉传世；尚可喜民族败类，大奸大恶，杀人无数，身后竟子孙满堂。
就在几年前，东北海城的尚氏后裔还花钱请了一些软骨学者，给他们的汉奸老祖下结论：“顺应潮流，认清大局，与时俱进。”
这真是天大的笑话！礼义廉耻，黑白颠倒。尚可喜这个杀人魔王、大汉奸，一下子被盖棺定论为“支持祖国统一的立下千古大功的‘好人’”。可叹的是，东莞袁崇焕家乡没有什么纪念设施，而在辽宁海城，却有一座新建的尚可喜纪念馆，其“王陵“还被当地政府出资修萁一新。
是非成败，转头皆空。但人间大义，绝不会因时间的流逝而有所改变。
尚可喜，这位制造广州大屠杀的汉奸，将会被永远钉在中华历史的耻辱柱上！
丹心难为利刃改——瞿式耜桂林殉国
孔有德方面，他的行军步伐，几乎与尚可喜同步。
顺治六年，孔有德在底定湖南后，提军进入广西境内，攻克要隘龙虎关，又陷全州，直逼桂林城下。
永历政权的留守大学士瞿式耜，烈士心态，坚决不逃，为中华民族精神家园添上一桩色彩浓烈的坚贞爱国故事。
有关瞿式耜在桂林的表现，其子瞿元锡所作《庚寅始安事略》记载最详。
清军节节逼近之时，桂林城内及附近的南明守军有数万之多，特别是赵印选、胡一青、王永祚的滇军，具有一定的战斗能力。可叹的是，兵为可战之兵，将皆庸碌之将。这几个军将不仅天天为争饷夺利搞内哄，他们脑子里没有任何忠孝仁义，完全是兵痞头子观念。
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木棉花开血样红（3）
大敌当前，这几个南明将领考虑的不是如何在战略要地防卫城池，而是日夜谋计如何取得更多的好处。
瞿大学士口干辱噪对几个兵头晓以“忠义”，皆成为他们的耳边风。
最让人感到诧异的是，瞿式耜派人催促桂林四周留守诸将移营备战，竟然发现，诸营皆空。
兵将集体遁逃，而且任何招呼不打。所以，清军尖兵还未抵达，明军已经全部逃光。
瞿式耜拍胸顿足大叹：“朝廷以高爵厚饷待此辈，百姓以膏血养此辈，今天竟然一矢不发即奔散，真猪狗不如！”
桂林城内兵将尽奔逃无遣，瞿式耜手下的家仆也星散四奔。甭说，也有个把有良心的，南明总兵戚良勋率几个兵士，牵两匹良马赶至，呼瞿式耜出逃。
瞿大学士瞋目叱喝：“尔等武臣，要去自去！我今天纵然逃走，不过是多活数日。自古至今，谁人不死，但我死也要死得明白，可有面目见祖宗于地下！莫再饶舌，否则吃我尚方宝剑！”
戚良勋呆楞片刻，掉转马头，飞奔而去。
瞿式耜一身明朝官服，在寂寞无人的府署中正襟危坐。
忽然，大门推开，从门外又闯进一人。瞿大学士定眼观瞧，原来是总督张同敞。这位爷不是别人，乃万历年间鼎鼎大名的张居正张阁老的曾孙。李闯入北京，崇祯帝上吊自杀，文武官员降者甚多，时为中书舍人的张同敞跑出城外，奔向南京。弘光政权倒台，他逃入福建，加入隆武政权。由于他老家在湖广，隆武帝派他去当地收服首鼠两端的流贼残军。可悲的是，时间不久，隆武帝遇害汀州。张同敞忠耿孤臣，闻讯仰天大哭，哀至泣血。永历继位于端州，他立刻奔往依从，一直作为大明的鼎鼎忠臣。
张同敞刚从周围督军而回，隔江遥见桂林城内一片死寂，询问逃亡难民，始知明军早已窜奔，桂林完全无人把守。
明知是危城，偏向危中行。张同尚单人独骑，昂然而入。
瞿式耜见张同敞入，稍感慰籍，劝说道：“我乃奉旨守臣，城存与存，城亡与亡，您乃军中都督，应该随军俱行。天下事，或尚可为，希望您能出城逃走。”
张同敞凛然一笑：“瞿公您能为朝廷死节，难道我张同敞不能吗？”
二人相视大笑。于是，一直伺侯瞿式耜不去的老兵献酒，二公畅饮欢谈，达旦不寐。
夜雨淙淙，他们遥见城外火光冲天，整个桂林城寂无声响。
鸡唱时分，老兵禀告：“清兵已经入城。”
二人饮酒依旧。
黎明时，瞿式耜平静对张同敞说：“我二人死期近矣！”
清军马队驰至，喧哗斥问。很快，有一队士兵突入，上前要捆绑二人。
瞿式耜慢慢站起，镇静言道：“我们二人已经坐待一夜，何用捆缚！”
当时，大雨如注，清军押二人在泥泞中蹒跚好久，才抵达桂林城内的靖江王府，被押见汉奸王爷孔有德。
据瞿式耜本人的《临难遗表》所记，当时的孔有德身边，“甲仗如云，武士如林。”汉奸王爷，排场极大。
瞿式耜、张同敞二人抱必死之心，面对汉奸贼王，傲然挺立。
孔有德踞地；坐一虎皮垫上。他早闻瞿式耜有忠义之名，举手作恭，问：“哪一位是瞿阁部先生，请坐下说话。”
瞿式耜：“我就是大明留守督师瞿式耜！我们中国人不习惯在地上盘坐。桂林既陷，惟求速死！夫复何言！”
孔有德并无慢怒之色，温言相劝：“我在湖南，已经知道瞿阁部留守桂林。现在入城更知二公不怕死，故意在此不去。本王绝不杀害忠臣，先生您何必求死？甲申闯贼入京，我大清已为先帝（崇祯）报仇，而且祭葬成礼，明朝人应该人人感谢才对。如今，人事如此，天意可知！希望瞿阁部不要自苦。自今以后，我掌兵马，您为我掌钱粮，安民众，同为大清效力。”
瞿式耜轻蔑一笑：“我为永历皇上供职，岂能为犬羊胡虏效力！”
孔有德面有不悦耳，仍强自隐忍：“我位居王位，于您而言，应无屈尊之理。”
瞿式耜嗤之以鼻：“安禄山、朱泚（两个唐朝叛将）皆自以为王，那是多么下贱的王爷啊！”
孔有德面红耳赤，争辩道：“我乃孔圣人后代，势会所迫，为大清驰驱，事已至此，瞿大人何必太过固执。”
张同敞一旁大喝：“孔有德狗贼，你不要污辱孔圣人。想你从前不过是皮岛毛文龙（被袁崇焕所杀的跋扈大将）手下提尿壶的家奴，怎敢以圣人之裔自居？”说着话，张同敞扑上前痛批孔有德双颊。
一句话，揭了老底。大巴掌，打得生疼。
孔有德大怒，立刻喝令兵士把张同敞五花大绑，逼其下跪。
张同敞大骂不止。
孔有德抡起卫士手中铁锤，砸折张同尚两个胳膊，又挥拳打瞎这位忠臣一只眼睛。
张同尚仍旧大骂不止。
瞿式耜见此，义愤填膺，喝斥道：“这是大明宫詹司马张同敞，自愿入城来与我同死。尔等鼠辈，安能如此折辱义士！”
孔有德不死心，接着劝降：“我二十岁左右，起兵海上，如今已经南面称孤为王。我投诚大清后，拥旄节，爵名王；瞿公，如果您今日降，明天就和我一样为大清重臣。常言道‘识时务者为俊杰’，大清自甲申（1644年）入中国，五年之间，南北一统。大清军队，至县县破，至州州亡！天时人事，盖可知矣！瞿公您守一城以扞天下，屡挫大清强兵，才能已见于天下。如果投降，一定转祸为福，建立非常之功业。如果不降，空以身血膏原野，天下人谁复知之！”
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木棉花开血样红（4）
瞿式耜轻蔑一笑。“你身为男子大丈夫，既不能尽忠本朝，复不能自起，于天下逐鹿称孤，恬然为人鹰犬，现在怎么还能以俊杰时务之辞欺我等堂堂丈夫？昔有少康、光武二帝，恢复中兴，天时人事，尚未可知。本阁部受累朝大德，位三公，兼侯伯，一直想殚精竭力，扫清中原。如今，我大志不就，自痛负国。刀锯鼎镬，百死莫赎。别的废话，不要对我多说！”
见劝降无效，孔有德命人把二人拘押于城北一间房子中，饮食公供帐皆精美，待以上宾之礼，接连派左右降人不断前去说降，劝谕百端。
面对说客，瞿式耜一直大哭大呼“大明”，张同敞一直大骂大斥来人。
无奈，劝降之人，皆悻悻而去。
孔有德派人送精美食物，皆为二公斥为“猪狗之食”，掀翻于地。
饿了四天之后，前明一个礼部主事为他们送来饭食，二人才受之而食。
被押期间内，二人幽囚唱和，各答诗篇十余章，总名为《浩气吟》。笔记《明季南略》详记瞿式耜诗八首，现摘录如下，以彰其忠诚报国之心：
其一
籍草为茵枕由眠，更长寂寂夜如年；
苏卿绛节惟思汉，信国丹心止告天。
九死如饴遑惜苦，三生有石只随缘；
残灯一室群魔绕，宁识孤臣梦坦然。
其二
已拼薄命付危疆，生死关头岂待商；
二祖江山人尽掷，四年精血我偏伤。
羞将颜面寻吾主，剩取忠魂落异乡；
不有江陵真铁汉，腐儒谁为剖心肠。
其三
正襟危坐待天光，两鬓依然劲似霜；
愿仰须臾阶下鬼，何愁慷慨殿中狂。
须知榜辱神无变，旋与衣冠语益庄；
莫咲老夫轻一死，汗青留取姓名香。
其四
年年索赋养边臣，曾见登陴有一人；
上爵满门皆紫绶，荒邨无处不青磷。
仅存皮骨民堪畏，乐尔妻孥国已贫；
试问怡堂今在否，孤存留守自捐身。
其五
边臣死节亦寻常，恨死犹衔负国伤；
拥主竟成千古罪，留京翻失一隅疆，
骂名此曰知难免，厉鬼他年讵敢忘；
幸有颠毛留旦夕，魂兮早赴祖宗旁。
其六
拘幽土室岂偷生，求死无门虑转清；
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