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杨崇伊上奏经过，（徐）凌霄一士随笔中记载甚详，内云：“御史杨崇伊之以危词耸后听政也，具折后谒庆亲王奕劻，蕲代奏。奕劻有难色，崇伊曰：此折王爷已见之矣，如日后闹出大乱子来，王爷不能诿为不知也。奕劻乃诺之，至颐和园见后，面奏崇伊有折言事。后犹作暇豫之状曰：闲着也是闲着，拿过来看看吧。既阅而色变，立召见诸大臣。”
杨崇伊字莘伯，江苏常熟人，光绪六年庚辰进士，由庶常授编修。光绪廿一年（1895年）授御史，就任后第一疏即于是年十一月首劾康有为、梁启超在北京所创设的强学会。结果奉旨查禁。光绪廿二年（1896年）又疏参翰林院侍读学士文廷式革逐回籍。文廷式是光绪宠爱的瑾妃和珍妃的老师。照常理而言，杨崇伊发难于先，告变于前，他个人能揣摸慈禧的心理，抓住时机，应该可以从此青云直上。却不料慈禧亲政后他并没有大富大贵。这与袁世凯对比，两人各自有命了。
杨不仅没有飞黄腾达，反而潦倒不堪，光绪卅四年（1908年）八月，以浙江后补道丁忧回籍守制，寄寓扬州，竟持枪纠众抢夺妓女，被江苏布政使瑞澂参劾，驱逐回常熟原籍，交地方言严加管束。
八月初六日的早上，慈禧乘銮舆直入光绪寝宫，把所有文件都拿走。光绪惊惶失措，战战兢兢地跪在太后面前，太后指着光绪恨恨地说：“我抚养你廿余年，你今天竟听信小人之言要谋害我，你还有良心吗？”光绪脸无人色，嗫嚅地说：“儿子怎敢！”慈禧说：“呸！痴儿，今日没有了我，明天还会有你吗！”
就在这一天，慈禧传旨重行临朝训政，理由是皇帝有病，需要休养。至于光绪皇帝，则被安置在三面环水的瀛台中“养病”。
慈禧重掌政权后，立即命步军统领崇礼率兵前往宣武门外的南海会馆捉拿康有为。康已于初五早上离开北京，崇礼只捕到康广仁和康的弟子程式毅、钱维骥。又去查抄了张荫桓寓所，把张也捕去。在搜捕康有为时，梁启超正在谭嗣同的寓所，听到了政变的消息，两人相对黯然。谭这时很镇静，慨然对梁说：“在这以前我们一心想救皇上，可是到现在则连救康先生也没有办法了，我现在只好等死，你赶紧到日本公使馆找伊藤博文，请他通知日本上海领事，设法援救康先生。”梁到日使馆后，外面情形更恶化，他便请日使馆给予政治庇护。谭在家中一直没有事，初七还跑到日使馆去看梁。梁和几个日本友人劝谭逃到日本去，谭说；“变法是大事业，应该流血的，中国人还没有为变法流过血，我愿以死来答报圣主。”谭在初十被捕，他在监中题了一首绝命诗在墙壁上：“望门投止思张俭，忍死须臾待杜根。我自横刀向天笑，去留肝胆两昆仑。”御史杨深秀在政变后竟上疏责问皇帝被废的原因，并反对慈禧训政，于是他便被捕了。初九早上杨锐在床上被捕。林旭是在军机处被扣。刘光第、徐致靖则是自己投案。
八月十三日下午二时，慈禧传旨：“谕军机大臣等：康广仁、杨深秀、杨锐、林旭、谭嗣同、刘光第等大逆不道，着即处斩。”下午四时，康等被押赴宣武门外菜市口行刑。康广仁首先受刑。谭嗣同就刑之前，对监斩官刚毅说：“过来，我有话讲。”刚毅红着脸走开。林旭厉声问：“我们未经审讯，究竟犯了什么罪？”这六个人是维新变法后，戊戌政变的牺牲者，后人便管他们叫“六君子”。张荫桓被遣戍新疆。徐致靖则被判永远监禁。其他株连坐罪的尚有李端棻、翁同棻、黄遵宪、张元济、宋伯鲁、陈宝箴、陈三立等20余人，或被发配，或革职永不叙用，或被囚禁，或交地方官严加管束。
六君子的简历如下：
康广仁：是康有为胞弟，习西医，因照料兄病赴京，维新后留京佐理康有为的文书。
杨深秀：山西人，曾任山东御史，力赞新政，曾劾守旧派许应。
杨锐：四川人，曾任内阁侍读，为张之洞得意门生，曾赞助强学书局，后加入康所成立的保国会。
林旭：福建人，曾任内阁中书，为荣禄幕客，是康的弟子。
谭嗣同：湖南人，江苏候补知府，才气纵横，学识渊博，曾在湖南倡行新政，极有成效。是康的私淑弟子。
刘光弟：四川人，刑部主事，曾参加保国会。
康有为挽六君子联云：
殷干酷刑，宋岳枉辱，臣本无恨，君亦何尤？魂魄果有灵，当效正学先生，启口问成王安在？
汉室党锢，晋代清谈，振古如斯，于今为烈。邦家况多难，恰如子胥相国，悬睛看越寇飞来。
慈禧重新训政后，立即把新政全部推翻，已裁汰的衙门和冗员一体恢复，八股文仍然交运，武科照旧考箭刀弓石。维新变法唯一留到后世的政绩，只有一个京师大学堂，便是北京大学的前身。
维新运动失败的因素很多，西太后不支持是最大的原因。事实上，西太后是代表守旧派，而守旧派则不只是几个人，相反的守旧派力量很大，不只在朝中，在野的很多读书人也是顽固地反对变法。中国读书人都是标榜奉行先王之法，所以倡行变法就是大逆不道，而变法的人也总是托古改制。
康有为提倡变法时，卫道者便群起而攻，如湖南的叶德辉给皮鹿门信中就说：“宁可以魏忠贤配享孔庭，使奸人知特遁之足贵，断不可以康有为扰乱时政，使四境闻鸡犬之不安；其言即有可采，其人必不可用。”又对人形容康有为：“其貌则孔，其心则夷。”
直接激起官场中整个反对的，是因为新政如果进行，就要打破了许多人的饭碗。在裁詹事府、通政司、光禄寺、鸿胪寺、太仆寺、大理寺等六个闲衙门的上谕颁布后，北京城内的官吏群情大哗。接着又要裁撤湖北、广东、云南三个巡抚，一个东河总督和许多不办运务的粮道，无盐场的盐道衙门。上谕中还说：“其余京外应裁文武各缺，命大学士、六部、各省将军、督抚，分别详议以闻。”于是“群情大骇，谓帝大背祖宗制度，皆赴宁寿宫请太后保全，收回成命。”
还有“废八股试帖楷法试法”表面上虽然没有妨害任何人，实际上也影响极大，因为当时整个教育内容便是为了考八股，无数的读书人日以继夜应付考试以求功名富贵，忽然晴天霹雳，废止了八股，读书人们的心血光阴都付诸流水，前功尽弃。年轻的人从头做起还来得及，年老的人岂不功名富贵无望了，他们对新政自然是痛心疾首。
梁启超分析这些现象说：
“……今守旧党之阻挠变法也，非实有见于新法之害国病民也。吾所挟以得拜第者，曰八股，今一变而务实学，则吾进身之阶将绝也。吾所恃以致高位者，曰资格，今一变而任才能，则吾骄人之具将穷也。吾所借以充私囊者，曰舞弊，今一变而窍名实，则吾子孙之谋将断也。……吾今日所以得内位卿贰，外拥封疆者，不知经若干年之资俸，经若干辈之奔竞而始获也。今既……不办一事，从容富贵，穷乐荣欲，已可生得大拜，死谥文端，家财溢百万之金，儿孙皆一品之荫。若一旦变法，则凡任官者皆须办事；吾将奉命而办事耶？则既无学问，又无才干，何以能办；将不办耶，则安肯舍吾数十年资俸奔竞千辛万苦所得之高官，决然引退以避贤者之路哉。”
“张之洞尝与余言，以废八股为变法第一事矣，而不闻上疏废之者，盖恐触数百翰林，数千进士，数万举人，数十万秀才，数百万童生之忌，惧其合力以谤己而排挤己也。”
一个社会，保守势力总是巨大的，谈改革就是要如何消灭愚昧和反动，把阻碍的守旧力量消灭，不能消灭保守的势力就无法革新。求变求新是时代的需要，一个社会要进步就要不断地求变求新。（霸气 书库 ｜。。）
十二、康有为逃脱
康有为八月初五早上离开北京，傍晚到了塘沽，就搭上招商局的海晏轮。海晏轮延期，乃于初六早上改搭太古公司的重庆轮，于11时开航。这时西太后已夺取了光绪的大权，北京政变已爆发了。不过康有为在船上一切都不知道，重庆轮过烟台停泊时他还上岸去买水果和石子。
康有为在搭乘轮船逃亡时，曾经留下两份遗书。
一封是写给他的弟子徐勤，托以后事，书云：
“吾以救中国，故冒险遭变，竟至不测，命也。然神明何曾死哉。君勉（徐勤的号）为烈丈夫，吾有老母 ，谨以为托，照料吾家人，力任大道，无忧虑也。同门中谁能仗义护持吾家吾国者，央神明嘉之。孔子生二千四百七十五年即光绪廿五年八月九日为绝笔告君勉仁弟，并示同门有志诸子。”
廿年后康有为60岁生日时，又在这封绝笔书上加跋，历叙当时逃亡经过，跋云：
“此吾戊戌八月九日奉密诏到沪，付托门人徐勤勉之绝笔书也。先是难将作，门人林旭两衔德宗朱谕来，第一诏命与同志筹救，谓朕位几不保，不胜焦灼之至。乃与谭复生谋召袁世凯图之。第二诏知为将陷不测，仍假托办官报，命往上海，曰汝一片热肠，朕所深悉，它日更效驰驱，共建大业，朕有厚望焉。且又曰：汝其爱惜身体，善自调摄。盖以在外或安，在内则危，故特遣出外以救之，先帝之若心也。惟为虽奉上命即行，仍欲留京营救，谭复生以救上事自任，幼博赞之，促吾行，黄仲弙告，令吾易僧服走蒙古，幼博跪力请，任公同固请，吾以死生命也，少年在粤遭华德里落砖，如死久死矣。仍往天津经荣禄督署，乃先上招商局船，以无上舱，改乘英人重庆船于六日十时行。是日侵晓难作，先帝遭废，六时步军兵围南海会馆，幼博弟与门人程大璋、钱维骥捕逮矣。即闭九城断铁道，发缇骑三千，大索于京师，谭、林、杨、刘四军机及杨漪川待御、徐子靖、张樵野两侍郎咸被逮，党狱大兴。既不得吾，则又大搜天津陆海，驰电全国，附以吾影像托于各国领事，连日沪船搜捕严密，而吾以五日晓出京，晏然不知也。七日船泊之罘，吾登船游眺，拾海滨五色石数篮而后登船。是时烟台道己奉密捕之电，惟有他事出，在舆中接电不识。及检知即还之罘，而吾船已行矣。乃命飞鹰兵舰逐吾重庆，而飞鹰适载炭不足，遂中道不及。将至沪，吾门人忧甚，纷纷租小轮舟出吴淞外接之，而实无从着力，盖洞察防范已备也。
九日至吴淞外卅海里，英吏登舟持吾像遍视，及吾，延入卧室，出像问曰：汝诚弑耶？吾惊问 ，乃出伪懿旨相视，曰康有为进丸毒弑大行皇帝，着即行就地正法，钦此！吾即大哭，即投海，英吏抱我曰：外传事未实，姑少待之，遂扶吾过英舰，然以为上必无幸，终当投海耳。乃赋诗曰：忽洒龙漦翳太阴，紫微移座帝星沉，孤臣辜负传衣带，碧海波涛夜夜心。更念老母无以为养，众门人忠肝义胆不以死生易心，不以寒暑易节，可以寄托者，莫如三水徐勤君勉，乃写此书及与吾内子张妙华夫人一书，令其善事吾母，附以诗，令仆藏之，俟吾不测。今阅廿年，君勉经海珠之变而无恙，吾与张夫人幸存，今日门人为吾与张夫人双寿介觞，张夫人亦于戊戌被捕幸脱者。
君勉在高弟被捕，麦孟、华孺、博五、觉任、公裕数人之列者。事阅廿年，吾岁六十，当览揆之日，君勉子良出此书请题，旧梦前痕，我心恻恻。
吾一身经万死本不足计，然吾如被逮于朝，先帝既夕弑，吾永为叛逆，若范蔚宗而国事立可知矣。然吾经十死而不死，今竟能介寿，岂非天命哉？然而此廿年中大劫频仍，朝市变易，国务日落、民生多艰，补天无力，重负先帝重建大业之望，深惭衣带之诏，一死固不足塞责，惟有愧恧感愤而已。此纸写于由重庆船渡兵舰之小轮舟中，索得舟中恶纸劣笔，匆遽写之，故不成书，聊以传言。君勉保存至今，从吾患难廿年如一，益敬不懈，夫与吾游而党者，不啻千万，其始勤终怠，或中道而变者，不可量数，贤哉君勉，臧洪畴也，横览天下岂可得哉。丁巳二月五日康有为年六十览揆时跋此。”
第二封也是在重庆轮所写的绝笔书云：
“我专为救中国，哀四万万人之艰难而变法以救之，乃蒙此难。惟来人间世发愿专为救人起见，期皆至于大同太平之治，将来生生世世，历经无量劫，救此众生，虽频任患难，无有厌改。愿我弟子，我后学体吾此志，亦以救人为事，虽经患难无改也。地球诸天随处现身，本无死理，至于无量数劫，亦出世人而已。聚散生死，理之常，出入其间何足异哉！光绪廿四年八月九日康长素遗笔。到此无可念，一切付之，惟吾母、吾君之恩未能报为可念也。”
康有为也在这篇绝笔书后题跋云：
“此光绪戊戌八月吾将投海时遗墨也。是时京师调兵三千，闭城断铁路而大索。吾以四日奉上密旨便行，五日遂行至津乘招商局船，而无上舱，遂以六日晓乘英重庆船行至沪，则沪又大搜矣。英领事派人以后旨见示，伪旨云已革某官康有为进丸毒弑大行皇帝，着即行就地正法，钦此。吾见上已大行，只有投海，英人抱我曰：闻上实在，虽欲死请少缓，姑待消息如何？乃投海未遂也，乃写此与门弟子，并与徐君勉一书，令其善视吾母，预为再投海计也。不意廿余年归国无恙，重睹是书于庐山黄龙寺婆罗双树之下，亦可感矣。吾虽不死，而中国日危，然亦可知死生有命，非人所能为此。廿年中自庚子拳匪之变，辛亥之革，南北之争，大官富豪死者如麻，吾故旧士亦鲜有生存者，若贫贱之民，死于沟壑兵燹不可数，而老夫尚能曳杖看山，与五老周旋，既感慨亦自意也。戊午八月朔康有为题”。
康有为逃抵香港后，北京消息虽多，都是恶劣万分的，尤其是六君子死难后，连收殓尸体的人都没有。康虽得活，却无能为力，只好拜托英人李提摩太。李提摩太是一位传教士，对中国当时维新运动出力不少，尤其是在戊戌政变后，他在中间奔走不遗余力，非常难得。下面是康写给李提摩太的密函：
第一函——
“李提摩太先生阁下：四日一别，并言敝国宫庭之变，仆是日受皇上密诏，令设法求救，而贵公使不在仍无及矣。五日即有大变，致我圣明英武，力变新法之皇上被废，并闻旋即遇弑矣。呜呼痛哉！伪临朝慈禧淫昏贪毒，守旧愚蔽，乃敢篡位幽弑，自称训政。夫天无二日，民无二主，安有临政廿年天子，英明变法如此，而待训政者哉？我国经义，帝者以嫡母为母，不为庶母为母，伪慈禧在同治则生母，在今上则为先帝一遗妾耳，岂可以一淫昏之宫妾而废圣明之天子哉？淫后毒死我显后，鸩我毅后，忧怒而死我穆宗，今又废